Компания не должна восстанавливать НДС после уничтожения недоброкачественной продукции.

Необходимость уничтожения недоброкачественной продукции в случае появления угрозы возникновения и распространения заразных болезней животных устанавливается решением субъекта Российской Федерации.

Но, если компания уничтожила недоброкачественную продукцию, то она не обязана восстанавливать НДС. Это правило распространяется на случаи, когда ликвидация товара связана с необходимыми мерами безопасности. Об этом Минфин сообщает в письме  от 23.08.2013  № 03-07-11/34617. В таких случаях суммы налога на добавленную стоимость, ранее принятые к вычету по уничтоженной продукции, восстанавливать не следует.